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全轉錄組測序
背景介紹
表觀基因組學修飾可以通過調控基因表達，參與細胞和組織分化、發育、衰老、環境適應等一系列過程。大量的研究表明，表觀遺傳修飾的異常也會引起細胞、組織、器官，乃至整個機體的結構和功能改變，甚至導致疾病的發生，尤其是 DNA 甲基化（DNA methylation）變化會伴隨著許多復雜疾病（如腫瘤、精神類疾病、心血管疾病等）的早期發生到后期發展，并可作為臨床疾病全過程管理（包括早期診斷、個性化醫療、復發檢測、慢性疾病的風險評估等）的生物標志物。因此，對DNA甲基化的深入研究有助于了解疾病發病機制，發現疾病相關的分子標志物，為精準醫學發展奠定基礎。
DNA甲基化與腫瘤風險預測
產品簡介
全基因組甲基化測序（Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS）是將重亞硫酸鹽處理方法和 Illumina 高通量測序平臺相結合，進行全基因組范圍內的精確甲基化研究。WGBS 可以達到單堿基分辨率，精確分析每一個胞嘧啶的甲基化狀態，從而構建精細的全基因組 DNA 甲基化圖譜。
技術路線圖
技術原理
提取后的DNA經酶切、富集后，利用重亞硫酸鹽進行處理，其原理是正常的胞嘧啶（C）經重亞硫酸鹽處理后會形成尿嘧啶（U）,在后期PCR時會形成胸腺嘧啶（T）。而經修飾的C（5mC/5hmC）則不會被重亞硫酸鹽轉化，在測序時保留為C。處理后的DNA后續通過二代測序檢測甲基化位點。
甲基化位點檢測原理
結果展示
相關性分析（左）； 甲基化程度熱力圖（中）； 聚類熱圖（右）
差異位點分布circos（左）； 無監督聚類樹狀圖（中）； 富集分析氣泡圖（右）
產品優勢
精準高效
基于全基因組重亞硫酸鹽轉化的WGBS法，實現單堿基分辨率的甲基化位點精準、高效定位。
金標準
精準獲得全基因組甲基化的C位點，是甲基化測序的金標準；
快速準確
全面分析不同處理對全基因組甲基化水平的影響，快速準確地找到差異甲基化區域。
送樣要求
應用方向
應用案例
異常甲基化是胰島素瘤中胰島素基因表達的基礎
發表雜志：Nature Communications（IF：14.919）； 發表時間： 2020年 10月； 應用技術：全基因組甲基化測序
人類胰島素瘤是一種罕見良性緩慢增殖，并產生胰島素的β細胞腫瘤，為研究者理解人類β細胞再生的途徑提供了分子“路線圖”。此前研究發現，β細胞體積增大和功能紊亂疾病——先天性高胰島素血癥，在11號染色體p15.5-p15.4印記區存在異常的甲基化。本文中，研究者比較了19個人類胰島素瘤和5組正常β細胞，通過甲基化測序分析，在瘤內發現了一致很高的異常甲基化模式。結果表明，異常的胰島素（INS）啟動子甲基化和轉錄因子表達的產生INS表達的另一種驅動因素， 用病理的、基于遠端增強子的轉錄調控形式取代了典型的PDX1 驅動的β細胞模式，推測由轉錄因子NFaT驅動INS失活， 而不是典型的PDX1 增強子復合物。
啟動子DNA甲基化對基因表達的影響
