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BD Rhapsody單細胞3'轉錄組+膜表面蛋白檢測
產品簡介
單細胞轉錄組測序如何進行單細胞的捕獲，是決定單細胞檢測成本和通量的關鍵步驟。高通量單細胞捕獲目前主流的有兩大策略，一種是以10x Genomics為代表的采用微流控芯片技術（Microfluidic） ，另一種，就是BD Rhapsody為代表的采用微孔板（Microwell） 技術。 BD Rhapsody單細胞分析系統包括BD Rhapsody卡式芯片、 BD Rhapsody上樣臺、 BD Rhapsody掃描儀三大部分。
BD Rhapsody上樣臺（左）； BD Rhapsody卡式芯片（中）； BD Rhapsody掃描儀（右）
技術原理
BD RhapsodyTM 卡式芯片由上萬個微孔組成，主要承擔樣本以及試劑的添加，在平面卡式芯片上，一個細胞與一個條碼標記微球（beads） 依次落入同一個微孔中，細胞裂解釋放mRNA并且與磁珠上的引物序列雜交，進而完成細胞的捕獲和mRNA反轉錄。磁性回收beads，抓取cDNA進行文庫構建并測序。接下來采用BD RhapsodyTM 單細胞分析系統進行數據分析，一次可以獲得100~10,000個單細胞的基因表達數據，實現單細胞水平鑒定和表征細胞類型的目的。
BD Rhapsody 微孔捕獲及標記細胞原理
BD Rhapsody 單細胞測序實驗流程圖
BD Rhapsody 單細胞表面蛋白檢測
結果展示
細胞分群圖（左）； 蛋白表達密度分布圖和熱圖分析（右）
Marker 基因聚類熱圖（左）； 基因表達擬時間分析（右）
產品優勢
超高通量
每個樣可檢測100-10,000個細胞；
多組學檢測
可以同時實現靶向mRNA+ 蛋白質+ VDJ CDR3的單細胞多組學研究；
系統可靠
可利用成像系統對單細胞捕獲過程進行質控；單細胞捕獲效率高達80%，多細胞比例<1%(1,000個細胞中)；
經驗豐富
百奧醫藥技術團隊現已累積100余種不同組織類型、數千余個樣品的單細胞測序經驗。
送樣要求
應用方向
應用案例
單細胞測序揭示HIV慢性感染MAIT細胞功能損傷新機制
Sustained IFN-I stimulation impairs MAIT cell responses to bacteria by inducing IL-10 during chronic HIV-1 infection
發表雜志：Science Advances （IF: 14.136）； 發表時間： 2020年 2月； 應用技術：BD Rhapsody單細胞轉錄組測序， BD Rhapsody單細胞表面蛋白檢測
HIV-1感染者的粘膜相關恒定T細胞（MAIT） 會發生功能受損，其機制尚不清楚。單細胞轉錄組結合表面蛋白分析顯示，與健康個體相比，隨著干擾素（IFN） 刺激基因上調， HIV-1感染者的外周MAIT細胞被高度激活。持續的IFN-α作用，通過觸發單核細胞產生高水平IL-10，抑制了MAIT細胞對大腸桿菌刺激的應答, 進而抑制IL-12（一個關鍵的MAIT細胞活化共刺激細胞因子）的分泌。阻斷IFN-α或IL-10受體，可以體外阻止HIV-1暴露引起的MAIT細胞功能障礙。此外，阻斷IL-10受體可顯著改善HIV-1感染者MAIT細胞的抗結核應答。研究發現證實了IFN-I/IL-10軸在HIV-1患者MAIT細胞功能障礙中的中心作用，這對開發針對HIV-1患者細菌共感染的抗IFN-I/IL-10策略具有意義。
T細胞亞群的單細胞轉錄和表面蛋白表達譜（左）； 基因和蛋白的差異表達分析（右）
IFN-I信號與HIV-1感染MAIT細胞功能障礙的相關性
