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全轉錄組測序
產品簡介
轉錄組測序是通過高通量測序技術全面快速的獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態下的幾乎所有轉錄本序列信息，包括編碼RNA和非編碼RNA，結合生物信息技術獲得RNA的表達和調控信息，檢測多種RNA的表達和變化，同時建立不同類型的非編碼RNA與mRNA之間的調控關系，探索RNA之間的相互作用，構建潛在的RNA調控網絡，系統的揭示生物現象背后RNA世界的轉錄調控規律。
技術路線圖
結果展示
基因表達量小提琴圖（左）； 樣本相關性圖（中）； 差異表達基因火山圖（右）
差異基因在染色體上的分布圖（左）； 差異表達模式聚類圖（中）； circRNA-miRNA-mRNA網絡圖（右）
送樣要求
應用方向
應用案例
全轉錄組測序識別與膽管癌相關的關鍵轉錄組特征
Whole-transcriptome sequencing identifies key differentially expressed mRNAs, miRNAs, lncRNAs, and circRNAs associated with CHOL
發表雜志：Therapy-Nucleic Acids（IF： 8.886） ； 發表時間： 2020年 9月； 應用技術： 全轉錄組測序
為了系統地評估膽管癌（CHOL） 的全轉錄組測序數據，以進一步了解該癌癥的轉錄組學特征和分子機制，本研究對8例CHOL患者的腫瘤（C） 和相應的非腫瘤鄰近腫瘤（CP） 進行了全轉錄組測序。與對照組相比，CHOL樣本中總共發現了2,895個差異表達的mRNA， 56個差異表達的microRNA， 151個差異表達的lncRNA和110個差異表達的circRNA。對與miRNA、 lncRNA和circRNA相關的差異表達基因的富集分析也鑒定了剪接體的功能。下調的hsa-miR-144-3p在競爭性內源性RNA（ceRNA） 復合體網絡中顯著富集，其中還包括7個上調和13個下調的circRNAs、 7個上調的lncRNAs、 90個上調和40個下調的mRNAs。
研究路線圖（左）； KEGG 通路富集的氣泡圖（右）
lncRNA-miRNA-mRNA互作網絡（左）； 競爭性內源性RNA(ceRNA)網絡（右）
